Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ5

4930524J08Rik, RIKEN cDNA 4930524J08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
4930524J08RikQ9CUJ5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms