Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud1Q9CUB6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud1Q9CUB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms