Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fcf1Q9CTH6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fcf1Q9CTH6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms