Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rprd1bQ9CSU0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms