Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Exosc5Q9CRA8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Exosc5Q9CRA8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms