Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ska2Q9CR46 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ska2Q9CR46 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms