Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR22

Tmem42, Transmembrane protein 42, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem42Q9CR22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmem42Q9CR22 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Tmem42Q9CR22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Tmem42Q9CR22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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