Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mri1Q9CQT1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Mri1Q9CQT1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms