Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atp5f1Q9CQQ7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atp5f1Q9CQQ7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms