Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ndufb9Q9CQJ8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms