Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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