Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nudt21Q9CQF3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nudt21Q9CQF3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms