Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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