Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sar1bQ9CQC9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sar1bQ9CQC9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms