Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
1700029P11RikQ9CQ68 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms