Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Rnaseh2cQ9CQ18 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Rnaseh2cQ9CQ18 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms