Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim26Q99PN3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim26Q99PN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms