Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sf3b1Q99NB9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sf3b1Q99NB9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms