Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Mrpl43Q99N89 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl43Q99N89 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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