Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Ms4a4dQ99N05 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ms4a4dQ99N05 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
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