Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Mccc1Q99MR8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Mccc1Q99MR8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms