Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SrrtQ99MR6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SrrtQ99MR6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms