Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nkd1Q99MH6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nkd1Q99MH6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms