Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PsphQ99LS3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PsphQ99LS3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms