Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cdk5rap3Q99LM2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cdk5rap3Q99LM2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms