Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nmd3Q99L48 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nmd3Q99L48 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms