Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU1

Dhdds, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Dhdds, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DhddsQ99KU1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
DhddsQ99KU1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms