Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rnf34Q99KR6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rnf34Q99KR6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms