Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ciao1Q99KN2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ciao1Q99KN2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms