Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Reep3Q99KK1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Reep3Q99KK1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms