Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ufsp2Q99K23 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ufsp2Q99K23 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms