Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT5

Krcc1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krcc1Q99JT5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Krcc1Q99JT5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms