Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Def8Q99J78 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms