Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apobec3Q99J72 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms