Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn16Q925N4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cldn16Q925N4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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