Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Sfxn4Q925N1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Sfxn4Q925N1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms