Protein–RNA interactions for Protein: Q924W9

Lmo1, Rhombotin-1, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo1Q924W9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lmo1Q924W9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Lmo1Q924W9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms