Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Alpk3Q924C5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Alpk3Q924C5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms