Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trim59Q922Y2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trim59Q922Y2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms