Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ubxn1Q922Y1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms