Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clip1Q922J3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clip1Q922J3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms