Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rpe65Q91ZQ5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms