Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc5a4bQ91ZP4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc5a4bQ91ZP4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms