Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx4Q91YJ2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms