Protein–RNA interactions for Protein: Q91XY5

Pcdhga3, Protocadherin gamma A3, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhga3Q91XY5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pcdhga3Q91XY5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pcdhga3Q91XY5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms