Protein–RNA interactions for Protein: Q91WL6

Snx11, Sorting nexin-11, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx11Q91WL6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx11Q91WL6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms