Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Klc3Q91W40 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Klc3Q91W40 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Klc3Q91W40 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms