Protein–RNA interactions for Protein: Q91VS8

Farp2, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp2Q91VS8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Farp2Q91VS8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Farp2Q91VS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms