Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cabp4Q8VHC5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cabp4Q8VHC5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms