Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM1

Rnf130, E3 ubiquitin-protein ligase RNF130, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf130Q8VEM1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rnf130Q8VEM1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf130Q8VEM1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf130Q8VEM1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Rnf130Q8VEM1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf130Q8VEM1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf130Q8VEM1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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